槽式堆肥系統(tǒng)將可控通風(fēng)與定期翻堆相結(jié)合，堆肥過程發(fā)生在長而窄的被稱作“槽”的通道內(nèi)。軌道由墻體支撐，在軌道上有一臺翻堆機(jī)。原料被布料斗放置在槽的首端或末端，隨著翻堆機(jī)在軌道上移動、攪拌，堆肥混合原料向槽的另一端位移，當(dāng)原料基本腐熟時，能剛好被移出槽外。

槽式翻堆機(jī)與條垛式翻堆機(jī)相似，它用旋轉(zhuǎn)的槳葉或連枷使原料通風(fēng)、粉碎、并保持孔隙度。有些機(jī)器由傳送帶來傳送堆肥、無需操作人員，機(jī)器利用控制開關(guān)可以自動工作。

大部分商業(yè)堆肥系統(tǒng)包括通氣管或安裝在槽上的布?xì)庋b置。在翻堆時，通過鼓風(fēng)機(jī)鼓風(fēng)并使堆肥原料冷卻。由于沿著槽的長度方向放置的原料處于堆肥過程的不同階段，因而沿著長度方向?qū)⒐娘L(fēng)槽分為不同的通風(fēng)帶。槽式堆肥系統(tǒng)可使用幾臺鼓風(fēng)機(jī)，每臺鼓風(fēng)機(jī)把空氣輸送到槽的一個地帶，并由溫度傳感器或定時器獨(dú)立控制。

系統(tǒng)的容量由槽的數(shù)量和面積決定。槽的尺寸必須和翻堆機(jī)的大小保持一致。如果有搬運(yùn)裝置能使翻堆機(jī)從一個槽轉(zhuǎn)移另一個槽上，那么一臺翻堆機(jī)能處理幾個槽。為了保護(hù)機(jī)器設(shè)備并控制堆肥條件，槽要建造在建筑物或溫室內(nèi)。如果在溫帶的氣候條件下，則僅需加上頂棚即可。

槽的長度和預(yù)定的翻堆次數(shù)決定了堆制周期。建議的鼓風(fēng)槽式堆肥系統(tǒng)的堆肥周期為2～4周。槽式堆肥系統(tǒng)的最大優(yōu)點(diǎn)是堆肥周期短、堆肥產(chǎn)品質(zhì)量均勻以及節(jié)約勞動力。盡管如此，整個系統(tǒng)的成本是比較高的。

國內(nèi)目前有一些大型堆肥廠采用槽式堆肥日處理規(guī)模可高達(dá)100余噸。